Silent Hill 4: The Room đã thay đổi nét đặc trưng của mình từ việc thay đổi địa điểm đến cách chơi (gameplay), phiên bản mới lần này có một số thay đổi nhỏ về mặt cấu trúc có thể làm người chơi hơi bỡ ngỡ.

Game đã được bổ sung một góc nhìn ở ngôi thứ nhất khi người chơi đang ở trong phòng 302 và sẽ chuyển trở lại ngôi thứ ba quen thuộc sau khi người chơi đã ra khỏi phòng và chiến đấu. Trong suốt quá trình chơi thì người chơi phải quay lại căn phòng 302 nhiều lần để tìm các manh mối và quan trọng hơn đây là chỗ save game duy nhất. Góc nhìn thứ nhất sẽ giúp người chơi nhìn rõ các đồ vật hơn vì căn phòng sẽ có những thay đổi đáng kể.

Ngoài ra, ở các bản trước, người chơi có thể tạm dừng để sử dụng bình bơm thêm máu. Tuy nhiên trong Silent Hill 4: The Room người chơi phải vừa bơm máu vừa phải chiến đấu, điều này khiến người chơi sẽ gặp khó khăn hơn. Vũ khí trong game chủ yếu là cận chiến (melee), súng hiếm hơn. Những loại vũ khí cận chiến này sẽ bị hỏng sau một thời gian sử dụng, buộc người chơi phải thay đổi vũ khí khác. Giống như việc bơm máu, người chơi phải vừa chơi vừa đổi vũ khí. Một điều nữa là với vũ khí cận chiến người chơi có thể "tụ" rồi mới ra đòn sẽ khiến quái vật mất một lượng máu lớn hơn.

Quái vật trong series game Silent Hill luôn ẩn chứa một điều gì đó, có thể là những tội lỗi trong quá khứ, sự sợ hãi, ức chế, nỗi khát khao hay cái chết. Những con quái vật trong game thường liên quan đến Walter, ví dụ như Wall Man, Gum Head hay Sniffer Dog thể hiện những nỗi sợ hãi của Walter lúc bé, Twin Victims tượng trưng cho hai đứa trẻ sinh đôi xấu số Billy và Miriam Locane bị Walter sát hại một cách dã man, Conjurer tượng trưng cho sự trở về với "mẹ" hay con trùm The One Truth, một trong những con trùm hiếm hoi trong game, là người bảo vệ "mẹ" của Walter.